交通部审计办公室成立于1998年，为正局级单位，内设综合处、审计处。目前人员编制6名，其中设正、副主任各1名，处长2名、副处长1名。主要职责是负责指导部属单位的内部审计工作，做好部管干部的离任（任期、任期终结）经济责任审计，对部行业管理中的重大财务收支和经济效益进行审计或审计调查。

　　审计办主要职责：
　　（1）贯彻党和国家关于审计工作的方针、政策、法规，拟定交通系统内部审计规章制度，参与部有关财经规章制度的制定工作；
　　（2）根据国家有关规定，对部属单位及其机构（含港澳地区）的国有资产保值增值、财务收支及经济效益进行审计或审计调查；
　　（3）组织实施对部管干部的离任（任期、任期终结）经济责任审计；
　　（4）组织实施对交通专项资金征收、使用及管理情况的审计或审计调查；
　　（5）组织实施对部行业管理中的重大财务收支和经济效益进行审计或审计调查；负责对部投资的交通建设项目进行审计；
　　（6）领导部属单位的内部审计工作，指导交通系统的内部审计工作；
　　（7）负责编报交通审计统计报表，组织交通系统内部审计信息交流；